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傳統的微生物顯微鏡下鑒定法簡介
檢測方法傳統的微生物鑒定法，乃將微生物以染劑染色后，置于顯微鏡下觀察其特殊之型態或構造。1988 Hibler 首先使用ZineSulfate-Lugol's Iodine 染色法測試清水中的梨形鞭毛蟲及隱孢子蟲。
但是利用傳統的細胞染色法很難在濃縮的水樣中區分微生物的種類，也無法準確的標定特定的微生物，所以誤判率非常高。
因為要由數量龐大的微生物中找出屬少數的梨形鞭毛蟲及隱孢子蟲，其難度不亞于將各色各樣的小玻璃珠鋪滿游泳池，
然后從中挑選出特殊花珠子有多少顆(孢囊的直徑約10 μm，載玻片邊長約 2cm，彈珠直徑約1 cm，游泳池每邊約20 m，其比例相當)。
所以目前甚少直接使用染色法來檢測水體中的原蟲。所以適當的梨形鞭毛蟲及隱孢子蟲檢測方法，必須對受測之原蟲具有專一性，使操作者能非常容易進行判定
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