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可與無虹膜癥同時出現的主要疾病包括：
一、米勒氏癥候群(Miller syndrome)：偶發性無虹膜癥的患者中約有30%，可併發威爾姆氏腫瘤(一般在五歲以前發作)，稱之為米勒氏癥候群；其他病癥還包括生殖泌尿道異常、智能遲鈍、顱顏畸形等。
二、葛拉斯彼氏癥候群(Gillespie syndrome)：無虹膜癥併有小腦運動失調及智能遲鈍時，稱之為葛拉斯彼氏癥候群；此疾為隱性遺傳，雖有無虹膜癥但病因不在PAX6基因，所以不會發生威爾姆氏腫瘤，主要病灶為小腦及部分大腦的發育不良。
三、青光眼：青光眼是無虹膜癥的主要視力喪失原因；一般多要到成年時才會發作，主要是因為前房隅角被殘馀的虹膜組織阻塞。
四、白內障：相關的白內障種類包括前極型、錐型、皮質型、層型、核型等；如果在出生時發現有明顯的白內障，就需要適時的手術以避免發生弱視。
五、水晶體移位
六、角膜異常：一般多為小角膜、角膜混濁、及角膜血管翳(一般在兩歲前，由上下兩側角膜開始發生)等；目前認為病因可能與角膜輪部干細胞(limbal stem cells)的不正常有關。
七、視神經與黃斑視小凹發育不良：主要造成視力減退及眼球震顫的原因；視神經或黃斑發育不良的程度與虹膜的缺損程度并無關聯。
八、斜視：主要會發生內斜視。
九、眼球震顫：可發生先天性眼球震顫，主要為鐘擺式眼球震顫(pendular nystagmus)；特點為兩眼規律且對稱的眼球震顫。
無虹膜癥的患者，都需要接受完整的基因篩檢與全身檢查，甚至直系親屬也應一同接受完整眼科檢查。至于無虹膜癥的治療主要針對屈光不良、角膜混濁、白內障、及青光眼等，但因為到目前為止仍沒有較佳的無虹膜癥治療方式，一般預后皆不良。
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