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微生物學的研究方法
節 微生物檢視法
第二節 微生物染色法
第三節 微生物血清學檢查
第四節 微生物分子生物學檢查
節 微生物檢視法
顯微鏡的分類及原理
顯微鏡可分為光學顯微鏡(light microscope)和電子顯微鏡(electron microscope)兩類。光學顯微鏡是利用鏡片將光線經數次折射而放大物體影像。電子顯微鏡則以電子束取代光線，磁場取代鏡片；如此能增加其解像力，用于觀察更細微的構造。
電子顯微鏡又可分為觀察細胞內部構造的穿透式電子顯微鏡，和觀察細胞表面的掃瞄式電子顯微鏡。
不過電子顯微鏡頗為龐大且昂貴，多用于研究為主。
一般醫院、檢驗室、實驗室的使用，則以光學顯微鏡為主。
其他尚有利用反折光，適于觀察螺旋體的暗視野顯微鏡(dark-field microscope)；適用于觀察活體細胞的相位差顯微鏡(phase-contrast microscope)；結合螢光染劑的螢光顯微鏡(fluorescent microscope)等。
第二節 微生物染色法
因為大部分的細菌是微小透明，必須經過染色，才能很快的在顯微鏡下觀察到。染色乃先將檢體涂薄薄一層于玻片上制成抹片，加上會與細胞特殊成份結合的化學染料；有的則再經脫色、沖洗與複染等步驟。
分為簡單染色法及鑑別染色法兩類。
簡單染色法
簡單染色法(simple stain)是使用單一染劑來染色。用以觀察細菌型態或自然排列情形。
堿性染料(Basic Dye)
酸性染料(Acid Dye)
中性染料(Neutxal Dye)
堿性染料
常用的包括甲基藍(methylene blue)、結晶紫(crystal violet)及番紅(safranin)等含陽離子染劑，可與帶陰性電荷的細菌核酸、細胞壁等結合。
酸性染料
常用的包括伊紅(eosin)及剛果紅(corgo red)等含陰離子染劑，通常做為細胞質染色之用。
中性染料
如由甲基藍與伊紅形成的複合鹽類。
鑑別染色法
鑑別染色法(differential stain)是使用兩種以上的染劑，可用來鑑別特殊的細菌或構造。
革蘭氏染色法
耐酸性染色法
其他染色法
革蘭氏染色法
此為最常用的鑑別染色法。首先以結晶紫將所有細菌染色，其次用革蘭氏碘液(Gram's iodine solution)讓結晶紫與細胞壁緊密結合。第三步為使用95%酒精脫色；依細胞壁成份不同，使得有些細菌原先染上的初染劑會脫掉，有些則不會。最后再以番紅當對比染劑，將被脫色的細菌再染上新的顏色。
依革蘭氏染色法的結果，可將細菌分為革蘭氏陽性菌[G(+)]和革蘭氏陰性菌[G(-)]兩大類。G(+)菌細胞壁脂質含量較低，經酒精作用后，菌體的通透性相對降低，結晶紫不易脫色，因此會呈現結晶紫的藍紫色。而G(-)菌細胞壁含較高量的脂質，當這些脂質經酒精溶解后，菌體的通透性增加，導致結晶紫被脫色，因此會呈現番紅染上的紅色（表2-1）。
耐酸性染色法
分枝桿菌(Mycobacterium) 如結核桿菌、痲瘋桿菌等，因其細胞壁含大量脂質，無法和革蘭氏染劑結合，需用此特殊法染色觀察。先加熱將洋紅(fuchsin)與細菌細胞壁脂質緊密結合，再用含酸的酒精脫色，一般非耐酸菌會脫色，再經甲基藍複染呈藍色；而分枝桿菌仍保留洋紅染劑，呈現紅色，因此稱為耐酸性染色法（圖2-1）。
其他染色法
鞭毛染色法、莢膜染色法、芽孢染色法及螢光染色法等，可用于特殊的細菌種類。Wright-Giemsa染色法則用來染血液中的寄生蟲。
陰性染色法
陰性染色法(negative stain)為使用印度墨汁(India ink)將背景著色，但不染菌體，便于觀察有巨大莢膜的微生物（如隱球菌），以及螺旋體等不易著色的細菌
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