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粗調節輪
粗調節輪是調整物鏡和樣本間距離的裝置。當顯微鏡之粗調節輪螺旋向前轉動，鏡頭則下降接近樣本或以右手向前轉動調節輪使鏡臺上升，讓樣本接近物鏡；反之則下降，使樣本與物鏡之距離拉遠。
細調節輪
使用粗調節輪只能夠粗略的調節焦距，若要得到最清晰的物象，則應使用細調節輪來做進一步的調整。細調節輪每轉動一圈可使鏡筒移動01毫米（100微米），以取得樣品較佳之焦距。
光源
較早的光學顯微鏡是利用自然光源來檢視物體，通常在鏡座上裝有反光鏡用來照明樣本。目前的光學顯微鏡鏡座上大都裝有光源，并設有電流調節鈕，以調節通過電流大小來調整光照的強度。
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